1996年以《实话实说》主持人崭露头角，受到欢迎。2003年7月开始主持《小崔说事》。2009年崔永元既主持，又主演了《电影传奇》，在节目中，既讲故事又演故事。2010任纪录片《我的抗战》总策划。2011年9月，“崔永元·新锐导演计划”在北京启动。

2012年4月14日，崔永元主持了第一期《谢天谢地，你来啦》。9月28日和周立波共同主持《小崔说立波秀》2013年9月22日，崔永元告别央视演出，露惜别意， 崔永元离职手续办完后，成立个人工作室。崔永元离职央视后加盟河南卫视并作为《成语英雄》的节目嘉宾。

2013年12月16日，崔永元正式从央视离职，入职中国传媒大学任教。